Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms