Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LRIT1Q9P2V4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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