Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CECR2Q9BXF3 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CECR2Q9BXF3 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms