Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms