Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms