Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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SRSF5Q13243 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SRSF5Q13243 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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SRSF5Q13243 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SRSF5Q13243 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SRSF5Q13243 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SRSF5Q13243 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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