Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms