Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms