Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC3P51654 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC3P51654 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms