Protein–RNA interactions for Protein: P13196

ALAS1, 5-aminolevulinate synthase, nonspecific, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALAS1P13196 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALAS1P13196 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms