Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TRAPPC3L-202ENST00000368602 1113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GSTA4-202ENST00000370960 859 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL391730.1-201ENST00000413739 921 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC018892.1-201ENST00000451098 265 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC044839.3-201ENST00000532068 860 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC02328-201ENST00000553668 741 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC092119.1-201ENST00000562640 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AP005264.2-201ENST00000586747 732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL391094.1-201ENST00000612442 966 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ATP6V1C1-203ENST00000518857 1501 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TMEM136-201ENST00000314475 1434 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CNMD-201ENST00000377962 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms