Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM228BP0C875 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM228BP0C875 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM228BP0C875 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM228BP0C875 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM228BP0C875 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM228BP0C875 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM228BP0C875 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM228BP0C875 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM228BP0C875 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM228BP0C875 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM228BP0C875 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms