Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VTNP04004 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VTNP04004 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VTNP04004 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VTNP04004 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VTNP04004 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VTNP04004 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VTNP04004 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VTNP04004 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VTNP04004 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VTNP04004 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms