Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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C9orf172C9J069 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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C9orf172C9J069 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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C9orf172C9J069 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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C9orf172C9J069 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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C9orf172C9J069 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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C9orf172C9J069 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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C9orf172C9J069 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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