Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C4orf47A7E2U8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C4orf47A7E2U8 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C4orf47A7E2U8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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