Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 C8orf17-202ENST00000625034 2775 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ZNF479Q96JC4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms