Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 HMGCS1-202ENST00000433297 3466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 POM121L1P-202ENST00000605258 1835 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 GIMAP1-GIMAP5-201ENST00000611999 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 LRRC8E-206ENST00000618098 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 C8orf17-202ENST00000625034 2775 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 FP700125.1-201ENST00000628622 3262 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 GREB1L-202ENST00000424526 6052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MADD-210ENST00000407859 5744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SLC4A11-201ENST00000380056 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SUOX-203ENST00000394109 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PRDM2-204ENST00000376048 2688 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 LINC01166-201ENST00000443633 2619 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 KLC4-215ENST00000479388 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 C1orf220-202ENST00000521244 2577 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SEMA6D-201ENST00000316364 6099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 NANP-201ENST00000304788 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 GIMAP6-203ENST00000618759 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 GABRR1-201ENST00000369451 1823 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AC005537.1-203ENST00000629291 1748 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ASIC1-208ENST00000552438 3327 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MATR3-237ENST00000509990 3249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AC010422.6-201ENST00000593682 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ANXA4-201ENST00000394295 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 DPY19L2P2-204ENST00000438364 3947 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CTAGE5-206ENST00000396158 3695 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 TMF1-201ENST00000398559 6849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ARSK-201ENST00000380009 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SULF1-223ENST00000616868 3381 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CCND1-201ENST00000227507 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms