Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ACTBP60709 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ACTBP60709 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ACTBP60709 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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