Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HIRAP54198 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HIRAP54198 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms