Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RANGAP1P46060 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms