Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FAM58BPP0C7Q3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FAM58BPP0C7Q3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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