Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms