Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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USP35Q9P2H5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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USP35Q9P2H5 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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USP35Q9P2H5 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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