Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms