Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC241952.1-201ENST00000612480 6897 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NRP1-201ENST00000265371 5882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC144A-206ENST00000399273 8686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGA7-201ENST00000518325 4605 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB15-201ENST00000231173 4017 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 EMG1-202ENST00000599672 4898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDH20-201ENST00000409204 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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