Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms