Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 CD22-205ENST00000544992 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ANKLE2-208ENST00000542282 3302 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA6D-201ENST00000434739 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 COLQ-201ENST00000383781 2784 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TATDN2P2-201ENST00000403590 2226 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PDIA6-204ENST00000404824 2236 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJA4-201ENST00000343789 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CHCHD7-201ENST00000303759 1684 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ASAH1-202ENST00000314146 1690 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PAK1-202ENST00000356341 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ACSBG2-202ENST00000586696 2739 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AK2-215ENST00000629371 3576 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SORBS2-203ENST00000319471 2824 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 G3BP1-201ENST00000356245 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TBX19-201ENST00000367821 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CIITA-212ENST00000618207 2844 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FAM234A-201ENST00000301678 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01122-207ENST00000452840 4077 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GLRA2-201ENST00000218075 3216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN9-201ENST00000271971 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms