Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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NPRL3Q12980 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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NPRL3Q12980 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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NPRL3Q12980 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
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NPRL3Q12980 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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NPRL3Q12980 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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NPRL3Q12980 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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NPRL3Q12980 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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NPRL3Q12980 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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NPRL3Q12980 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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