Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms