Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms