Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms