Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LMO4P61968 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms