Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXP28300 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXP28300 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXP28300 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms