Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms