Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 MIR6749-201ENST00000617008 69 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 CREB5-205ENST00000409603 1944 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC145285.1-201ENST00000469929 694 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 U62317.4-201ENST00000609758 448 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 ZNF551-202ENST00000596085 469 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 FXYD3-210ENST00000604621 548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC090587.1-201ENST00000415809 494 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DMDP11532 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
DMDP11532 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DMDP11532 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DMDP11532 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC020893.2-201ENST00000506083 723 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 LCN12-202ENST00000371633 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 MOG-232ENST00000490427 327 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms