Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
U3KQV3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
U3KQV3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
U3KQV3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
U3KQV3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
U3KQV3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
U3KQV3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
U3KQV3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
U3KQV3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
U3KQV3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
U3KQV3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
U3KQV3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
U3KQV3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
U3KQV3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
U3KQV3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
U3KQV3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
U3KQV3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
U3KQV3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
U3KQV3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
U3KQV3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
U3KQV3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
U3KQV3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
U3KQV3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
U3KQV3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
U3KQV3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
U3KQV3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
U3KQV3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
U3KQV3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
U3KQV3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
U3KQV3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
U3KQV3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
U3KQV3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
U3KQV3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
U3KQV3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
U3KQV3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
U3KQV3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
U3KQV3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
U3KQV3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
U3KQV3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
U3KQV3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQV3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQV3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQV3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQV3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQV3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQV3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQV3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQV3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQV3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQV3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQV3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQV3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQV3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQV3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
U3KQV3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
U3KQV3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
U3KQV3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
U3KQV3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
U3KQV3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
U3KQV3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
U3KQV3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
U3KQV3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
U3KQV3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
U3KQV3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
U3KQV3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
U3KQV3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
U3KQV3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
U3KQV3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
U3KQV3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
U3KQV3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
U3KQV3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
U3KQV3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
U3KQV3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
U3KQV3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
U3KQV3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
U3KQV3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
U3KQV3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
U3KQV3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
U3KQV3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
U3KQV3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
U3KQV3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
U3KQV3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
U3KQV3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms