Protein–RNA interactions for Protein: R4GN34

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GN34 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
R4GN34 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
R4GN34 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
R4GN34 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
R4GN34 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
R4GN34 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
R4GN34 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
R4GN34 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
R4GN34 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
R4GN34 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
R4GN34 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
R4GN34 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
R4GN34 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
R4GN34 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
R4GN34 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
R4GN34 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
R4GN34 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
R4GN34 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
R4GN34 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
R4GN34 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
R4GN34 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
R4GN34 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
R4GN34 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
R4GN34 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
R4GN34 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
R4GN34 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
R4GN34 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
R4GN34 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
R4GN34 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
R4GN34 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
R4GN34 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
R4GN34 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
R4GN34 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms