Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms