Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms