Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms