Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD54BQ9Y620 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms