Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms