Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NRXN3Q9Y4C0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NRXN3Q9Y4C0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NRXN3Q9Y4C0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NRXN3Q9Y4C0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NRXN3Q9Y4C0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
NRXN3Q9Y4C0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NRXN3Q9Y4C0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NRXN3Q9Y4C0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NRXN3Q9Y4C0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NRXN3Q9Y4C0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
NRXN3Q9Y4C0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NRXN3Q9Y4C0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NRXN3Q9Y4C0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NRXN3Q9Y4C0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms