Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HCC1Q9Y3T6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 280.4 ms