Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDGFL3Q9Y3E1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDGFL3Q9Y3E1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms