Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms