Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQM7

CAMK2A, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2AQ9UQM7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2AQ9UQM7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAMK2AQ9UQM7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAMK2AQ9UQM7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAMK2AQ9UQM7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAMK2AQ9UQM7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms