Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPS5Q9UPZ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms