Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms