Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTF2Q9UNY4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms